Biologie cellulaire et moléculaire

Biologie cellulaire et moléculaire :

Cours Eric Vives :

Propriétés physicochimiques des AN :

[pic 1]

Présence de liaisons hydrogène (+++)

Présence de noyaux insaturés bases aromatiques (+++)

Présence de phosphates (---)

Liaison H : de 1,5 à 1,8 kcal/mole

Appariement A/T (2 liaisons hydrogènes : 3,5 kcal)

Appariement G/C (3 liaisons hydrogènes ; 5,5 kcal)

Présence plans de noyaux insaturés superposés (bases aromatiques) (Force de VW)

Forces de Van der Waals : (FVW)[pic 2]

Distance interatomiques A^°

34 A^° / 10 = 3,4 Angstrom entre 2 plans de pdb

[pic 3]

Structure de l’ADN :

L’ADN est moléculairement dynamique, et peut, sous l’influence de divers facteurs, changer de conformation, afin de modifier le rôle fonctionnel associé à sa séquence.

Ces modifications peuvent favoriser des cassures de l’ADN (et les délétions potentiellement induites par ces cassures mais aussi des amplifications, des recombinaisons ou des mutations)

Structure de l’ADN :

[pic 4]

A-DNA : 11 pb/tour de 28 Angstrom

Grand sillon large (11 Angstrom)

Petit sillon inaccessible (2,7 Angstrom)

🡪 + Compacte

B-DNA : 10,5 pb/tour de 34 A

Grand sillon large (11,7 A)

Petit sillon étroit (5,7 A)

Z-DNA : 12 pb/tour de 46 A

Petit et grand sillon ≈

[pic 5]

Rouge : ADN Z et vert : ADN B

ADN-Z riche en GC2, proche des promoteurs, stimule la transcription

Présent dans l’ADN « Déshydraté » ou suite à la fixation de certaines protéines (ADN-polymérases)[pic 6]

Possibilité d’être une structure de prédilection dans les hybrides ADN-ARN et dans les ARN double brin

[pic 7]

Technique d’électrophorèse en gel d’agarose : ☺

[pic 8]

[pic 9]

[pic 10]

[pic 11]

CoT :  concentration en [AN]// au tps

Facteurs influençant l’hybridation de l’ADN :

La [C] ,

Paramètre cinétique : Cot (en mole x sec/L)

Une solution d’ADN diluée incubée pendant un tps longs aura la même capacité de réhybridation à son brin complémentaire qu’une solution concentrée d’ADN incubée pendant un tps court.

[pic 12]

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