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TP Expression du patrimoine génétique

TD : TP Expression du patrimoine génétique. Recherche parmi 304 000+ dissertations

Par   •  15 Avril 2026  •  TD  •  1 658 Mots (7 Pages)  •  7 Vues

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[pic 1]TP Expression du patrimoine génétique

Les gènes sont à l’origine de la production de protéines. Nous allons donc chercher à comprendre comment l’information génétique (ADN) est utilisée pour permettre la production d’une protéine.

Matériel :

Ordinateur muni du logiciel GenieGen2 et LibMol

Fiche technique : libMol et GenieGen2

Fiche protocole : comprendre le fonctionnement général de la transcription et de la traduction

Activités et déroulement des activités

Capacités et critères de réussite

Activité 1 : Comprendre le fonctionnement général de la transcription

  • Quelle est la fonction du messager ? (fiche protocole identifier la nature de l’ARNm)
  1. Utilisez GenieGen2 pour transcrire les séquences d’ADN de l’hémoglobine Béta (HBB) (Banque de séquences du logiciel). Réalisez une capture d’écran annotée.
  •  Plusieurs formes de messagers ? (fiche protocole identifier la maturation de l‘ARNm)
  1. Utilisez GenieGen2 pour comparer les séquences des différents ARN d’un même gène (Gène CALC A). Réalisez une capture d’écran annotée

  1. Compléter le schéma du document 2 qui récapitule les étapes de la transcription
  2. Compétez le schéma du document 3 (légendes attendues : ARN pré-m, ARNm, exon (partie conservée dans l’ARNm), intron (partie non conservée dans l’ARNm, enzyme).

Activité 2 :  Comprendre le fonctionnement générale de la traduction 

  • L’importance des ribosomes (fiche protocole identifier l’importance des ribosomes pour la traduction)
  1. Analysez le document 1 pour justifier l’importance des ribosomes dans la production des protéines. Complétez le schéma (légendes attendues : ADN, signal de fin de transcription, ARN polymérase, ARN en cours de synthèse, ARN terminé)
  2. Utilisez le logiciel LibMol pour confirmer ces éléments.
  • L’identification du code génétique (fiche protocole identifier les modalités de la traduction) 
  1. Utilisez le logiciel GenieGen2 afin de prouver que la traduction se fait dans un seul sens et que la lecture se fait par groupe de 3 nucléotides (codons).
  2. Par le calcul, vous déterminerez :

- le nombre de combinaisons possibles d’ARN pour 2, 3, 4 et n nucléotides

- le nombre de combinaisons possibles de protéines pour 2, 3, 4 et n acides aminés

En déduire les caractéristiques principales du code génétique (document 5).

  • Les phases de la traduction  la vidéo et le document 6 afin de comprendre le fonctionnement du ribosome et d’identifier les phases de la traduction.

Extraire, recenser, organiser des informations

Je vois que … J’en déduis que … Mise en relation

Utiliser un logiciel de modélisation moléculaire (LibMol)

Utiliser la fonction rechercher ; Manipuler les différentes représentations (rubans, chaînes, sphères …) ; identifier les nucléotides en utilisant la coloration par résidus.

Utiliser un logiciel de traitement de données (GenieGen2)

Banque de séquence > « Comparaison allèles HBB (drépanocytose) ; Produire le brin complémentaire de l’ADN puis comprendre quel brin est transcrit. Identifier les différences entre l’ADN non transcrit et l’ARNm.

Utiliser un logiciel de traitement de données (GenieGen2)

Banque de séquence > « Epissage alternatif, cas du gène CALC A », comparer les séquences (Alt+A), réaliser des dot-plots.

Communiquer à l’écrit, choisir le mode de représentation ; Réaliser un schéma

Captures d’écran à annoter à la main (plus facile, ne pas oublier le titre, la légende, des couleurs.

Extraire, recenser, organiser des informations

Je vois que … J’en déduis que … Mise en relation

Utiliser un logiciel de traitement de données (GenieGen2)

Rechercher dans la base de données (Comparaison allèles HBB (drépanocytose) ; Savoir copier une séquence, Savoir saisir/coller une séquence, savoir réaliser la traduction, savoir comparer les séquences.

Appliquer une démarche déductive

Argumentez vos calculs, expliquez ce que vous faites

Recherchez des informations sur le nombre de permutation P

Utiliser des supports numériques

Rédigez une courte synthèse de la vidéo et des étapes de la traduction

Réaliser un schéma

Technique : Utilisez une page entière, titrez, utilisez de la couleur

Renseignement : Légendez sans erreur

Organisation : Soyez explicites (nom des étapes, phases)

Fiche protocole « Comprendre le fonctionnement général de la transcription »

IDENTIFIER LA NATURE DE L’ARNm

Matériel

- site : GenieGen2 

Remarques :

- Les actions peuvent être faites dans le menu « Action » mais également en faisant un clic droit sur la séquence à utiliser.

1- Accéder à GenieGen2

2- Charger les séquences « Comparaison allèles HBB (drépanocytose) »

3- Supprimer la séquence HBB S

4- Produire le brin complémentaire de HBB A (Action, convertir en brin complémentaire)

5- Transcrire le brin complémentaire (HBB A cpl) en l’utilisant comme brin matrice (brin transcrit)

6- Comparez la séquence de l’ARNm produit et celle des 2 brins de l’ADN initial.

IDENTIFIER LA MATURATION DE L’ARNm

Matériel : site GenieGen2 

Remarques :

- La comparaison des séquences peut se faire avec le raccourci Alt+A

- Les dot-plots ont pour objectif de comparer 2 séquences. Un trait sombre signifie que les séquences sont identiques.

1- Accéder à GenieGen2

2- Charger les séquences « Epissage alternatif, cas du gène CALC A »

3- Comparez les 3 séquences proposées (ARN pré-messager et 2 ARN messagers)

4- Cocher l’ARNpm et une des séquences et réaliser un dot plot

5- Cocher l’ARNpm et l’autre séquence et réaliser un dot plot (action réaliser un dotpot)

Une suite de points disposés en diagonale indique les régions de similarité entre les 2 séquences.

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